解:$(1)$如图①所示:
$AC+CE=\sqrt{{x}^2+25}+\sqrt{{x}^2-16x+65},$
当$A、$$C、$$E$在同一直线上,$AC+CE$最小;
$(2)$作点$N$关于$x$轴的对称点$N',$连接$MN'$交$x$轴于点$P,$此时$PM+PN$的值最小,等于$MN',$
过点$M$作$y$轴的垂线交射线$N'N$于点$A,$如图②所示.
$∵N(3,$$2),$
$∴N'(3,$$-2).$
设直线$MN'$得解析式为$y=kx+b,$
则$\{\begin{array}{l}{b=4}\\{3k+b=-2}\end{array},$
解得$\{\begin{array}{l}{k=-2}\\{b=4}\end{array}.$
$∴y=-2x+4.$
当$-2x+4=0$时,$x=2,$
$∴P(2,$$0).$
在$Rt△AMN'$中,$AM=3,$$AN'=6,$
$∴MN'=\sqrt{A{M}^2+AN{'}^2}=\sqrt{{3}^2+{6}^2}=3\sqrt{5}.$
$∴PM+PN$最小值为$3\sqrt{5}.$