$解:(1)设《周髀算经》单价为x元，$
$则《孙子算经》单价是\frac{3}{4}x元$
$依题 意得，\frac{600}{\frac {3}{4}x}=\frac{600}{x}+5$
$解得x=40$
$经检验，x=40是原方程的解，且符合题意$
$\frac{3}{4}×40=30(元)$
$答:《周髀算经》单价为40元,《孙子算经》单价为30元。$
$(2)设购买m本《周髀算经》$
$则购买(80-m)本《孙子算经》$
$依题 意得，m≥\frac{1}{2}(80-m)，解得m≥26\frac{2}{3}$
$设购买《周髀算经》和《孙子算经》的总费用为y元$
$依题意得，y=40×0.8m+30×0.8(80-m)=8m+1920$
$∵k=8＞0,...y随m的增大而增大$
$∴当m=27时，y有最小值,80-27=53(本)$
$答:当购买27本《周髀算经》,$
$53本《孙子算经》时，购买两种图书总费用最少$
