$解:(1)∵ 四边形OABC是矩形,点A,C在坐标轴上,∴AB⊥x轴,BC⊥y轴$
$∵点D的坐标为(4,1),且D为AB的中点,∴点B的坐标为(4,2),∴点E的纵坐标为2$
$∵反比例函数y=\frac{k}{x}(x>0)的图象过点D(4,1)和点E,∴k=4×1=4$
$∴反比例函数的解析式为y=\frac{4}{x}(x>0)$
$当y=2时,x=2, ∴点E的坐标为(2,2)$
$(2)把D(4,1)代入y=x+m,得4+m=1,解得m=-3;$
$把E(2,2)代入y=x+m,得2+m=2,解得m=0$
$∴m的取值范围是-3≤m≤0$