证明:$(1)$∵四边形$ABCD$是平行四边形
∴$AB=CD$,$AD=BC$,$AB//CD$,$AD//BC$,$∠ABM=∠CDN$
∵$BM=DN$
∴$△ABM≌△CDN(\mathrm {SAS})$,∴$AM=CN$
$(2)$由$(1)$,得$AB//CD$,$AD//BC$,$AB=CD$,
$AD=BC$,$△ABM≌△CDN$
∴$∠AMB=∠CND$,$∠CND=∠BCN$,$∠ADB=∠CBD$,
$∠BAM= ∠DCN$,$∠ABE = ∠CDF$,
即$∠AMB = ∠BCN$,$△ABE ≌ △CDF(\mathrm {ASA})$
∴$AM//CN$,$AE=CF$,即四边形$AECF $是平行四边形
∵$AB=AD$
∴$AB=BC$,$∠ABD = ∠ADB$,即$ ∠ABD =∠CBD$
∵$BE=BE$,∴$△ABE≌△CBE(\mathrm {SAS})$,∴$AE=CE$
∴四边形$AECF $是菱形