解:$(1)$∵$CD$是$Rt△ABC$的斜边中线
∴$CD= BD$
∴$∠DCB=∠B$
∵$∠HAC+∠ACH=90°,$$∠ACH+∠DCB=90°$
∴$∠HAC=∠DCB=∠B$
∵$AH= 2CH$
∴$AC=\sqrt{AH²+ HC²}=\sqrt{5}CH$
∴$sin B= sin∠HAC =\frac {HC}{AC}=\frac {\sqrt{5}}{5}$
$(2)$∵$CD=\sqrt{5}$
∴$AB= 2CD= 2\sqrt{5}.$
∵$sin B =\frac {\sqrt{5}}{5}$
∴$AC=2$
∴$BC=2AC=4$
∵$∠HAC=∠B,$$∠AHC=∠ACB$
∴$△ACE∽△BCA$
$\frac {CE}{AC}=\frac {AC}{BC}$
∴$CE=1$
∴$BE=BC-CE=3$