解$:(1)$因为$AE$是边$BC$上的高,所以$∠E=90°.$
又因为$∠ACB=100°,$$∠ACB+∠ACE=180°,$所以$∠ACE=80°.$
因为$∠CAE+∠ACE+∠E=180°,$所以$∠CAE=180°-90°-80°=10° $
$(2) $因为$AD$是边$BC$上的中线,$DC=4,$所以$BD=DC=4.$
因为$S_{△ABD}=\frac {1}{2}BD·AE=6,$即$ \frac {1}{2} ×4×AE=6,$所以$AE=3 $