解:$(1)$将$(1,$$0)、$$(2,$$0)、$$(3,$$4)$代入函数得
$\begin{cases}a+b+c=0\\4a+2b+c=0\\9a+3b+c=4\end{cases} $ 解得$\begin{cases}a=2\\b=-6\\c=4\end{cases}$
∴$y=2x^2-6x+4$
$(2)y=2x^2-6x+4=2(x-\frac 32)^2-\frac 12$
∴顶点坐标为$(\frac 32,$$-\frac 12)$
$(3)$当$x>\frac 32$时,$y$随$x$的增大而增大;当$x<\frac 32$时,$y$随$x$的增大而减小