解:$(1)$将点$C$代入反比例函数表达式得$-1=\frac m 6,$$m=-6$
∴$y=-\frac 6x$
∵$DE=3,$令$y=3,$$-\frac 6x=3,$$x=-2$
∴$D(-2,$$3)$
将点$C(6,$$-1)、$$D(-2,$$3)$代入一次函数表达式得
$ \begin{cases}6k+b=-1\\-2k+b=3\end{cases},$解得$\begin{cases}k={}-\dfrac 12\\b=2\end{cases}$
∴一次函数表达式为$y=-\frac 12x+2$
$ (2)$当$ x<-2 $和$ 0<x<6 $时, 一次函数的值大于反比例函数的值