解:$(1)$连接$OD,$设$\odot O$的半径为$r$
∵$AB⊥CD$
∴$∠OED=90°,$$DE=CE= \frac {1}{2}\ \mathrm {CD}= \frac {1}{2} ×8=4$
在$Rt△ODE$中,∵易得$OE=r-2,$$OD=r,$$DE=4$
∴$(r-2)²+4²=r²$
解得$r=5,$即$⊙O$的半径为$5$
$(2)$在$Rt△BCE$中,∵$CE=4,$且易得$BE=AB-AE=8$
∴$BC= \sqrt {CE²+BE²}=4 \sqrt {5}$
∵$OF⊥BC$
∴$BF=CF=\frac {1}{2}\ \mathrm {BC}=2 \sqrt {5},$$∠OFB=90°$
在$Rt△OBF $中,$OF= \sqrt {OB²-BF²}=\sqrt {5}$