解：$(2)$选择研学基地$C$的学生人数为$24×25\%=6$
选择研学基地$D$的学生人数为$24-2-12-6=4，$补全条形统计图如图所示
$(3)480×25\%=120($名)
∴ 该校选择研学基地$C$的学生人数是$120 $
$(4)$选择研学基地$D$的学生有$2$名男生和$2$名女生
画树状图如图所示
由图，可知共有$12$种等可能的结果，其中所选两名学生都是男生的结果有$2$种
∴$ P($所选两名学生都是男生$)= \frac {2}{12} = \frac {1}{6}$
