解:$(1)$∵射线$OC$是$∠AOB$的平分线,$∠AOB=120°$
∴$∠BOC=\frac {1}{2}∠AOB=60°$
∴$∠COD=∠BOC-∠BOD=60°-20°=40°$
$(2)①$当点$D$在$∠BOC$平分线的上方,如图
∵$∠AOE=∠EOD-∠AOD$
∴$∠AOE=90°-∠AOD$
∵$∠BOD=∠AOB-∠AOD$
∴$∠BOD=120°-∠AOD$
∴$∠BOD-∠AOE=120°-∠AOD-(90°-∠AOD)=30°$
$ ②$当点$D$在$∠BOC$平分线的下方,如图
∵$∠AOE+∠BOD=∠AOB-∠EOD$
∴$∠AOE+∠BOD=120°-90°=30°$
∴$∠BOD$和$∠AOE$之间的数量关系是
$∠BOD-∠AOE=30°$或$∠AOE+∠BOD=30°$