$解:(1)相等,理由如下:$
$∵四边形ABCD为菱形,$
$∴AB=AD,$
$∵△AEF为等边三角形,$
$∴AE=AF,且AE=AB,$
$∴AB=AE=AF=AD,$
$∴∠B=∠AEB=∠D=∠AFD,$
$∴∠BAE=∠DAF;$
$(2)由(1)可知∠BAE=∠DAF=x°,$
$∴∠BAD=∠BAE+∠DAF+∠EAF=60°+2x°,$
$∴∠B=180°-∠BAD=180°-(60°+2x°)=120°-2x°,$
$∠C=∠BAD=60°+2x°;$
$(3)在△ABE中,AB=AE,∠BAE=x°,$
$∴∠B=\frac 12(180°-x°)=90°-\frac 12x°,$
$又由(2)可得∠B=120°-2x°,$
$∴90°-\frac 12x°=120°-2x°,$
$解得x=20$
$∴∠AEB=∠B=80°,$
$∴∠CEF=180°-∠AEB-∠AEF=180°-80°-60°=40°.$