解:$ (1)E = mc^2=0.003×(3×10^8)^2$
$=2.7×10^{14}($焦耳$),$
所以该能量有$2.7×10^{14}$焦耳。
$ (2)(2.7×10^{14})\div (4.5×10^7) = 6×10^6($千克$),$
所以等同于$6×10^6$千克汽油完全燃烧产生的能量。
$ (3)(6×10^6)\div 0.75 = 8×10^6($升$),$
所以汽油的体积共有$8×10^6$立方分米。
因为$8×10^6=(2×10^2)^3=200^3,$
所以要使得恰好装满汽油,正方体容器的棱长
为$200$分米。