$解:(1)根据题意,得甲两次购买饲料的平均售价是\frac {1000(m+n)}{1000×2}=\frac {m+n}2(元/千克)$
$乙两次购买饲料的平均售价是\frac {800+800}{\frac {800}m+\frac {800}n}=\frac {2mn}{m+n}(元/千克)$
$(2)甲、乙两次购买饲料的平均售价的差是\frac {m+n}2-\frac {2mn}{m+n}=\frac {\ \mathrm {{m}^2}+2mn+{n}^2-4mn}{2(m+n)}=\frac {{(m-n)}^2}{2(m+n)}(元/千克)$
$∵m,n为正数,且m≠n$
$∴\frac {{(m-n)}^2}{2(m+n)}>0$
$∴\frac {m+n}2>\frac {2mn}{m+n}$
$∴乙的购买方式比较合算$