解:$(1)$∵点$D$,$E$在直线$MN$上运动,
$CE$平分$∠BCD$,$∠ACB=90°$
∴点$E$在点$A$的右侧
∵点$D$在点$A$左侧
∴$∠CAD+∠CAE=180°$
$(2)$∵点$D$,$E$在直线$MN$上运动,
$CE$平分$∠BCD$,$∠ACB=90°$
∴点$E$在点$A$的右侧
∵$△CDE$是直角三角形
∴$∠CDE=90°$或$∠CED=90°$
$①$若$∠CDE=90°$,如图$(1)$
则$∠CAD=∠CAE=60°$,$∠CDA=∠CDE=90°$
∴$∠ACD=180°-∠CDA-∠CAD=30°$
∵$∠ACB=90°$
∴$∠DCB=∠ACB-∠ACD=60°$
∵$CE$平分$∠BCD$
∴$∠DCE=∠ECB=\frac {1}{2}∠BCD=30°$
$②$若$∠CED=90°$,如图$(2)$
∵$∠CAE=60°$
∴$∠ACE=180°-∠CEA-∠CAE=30°$
∵$∠ACB=90°$
∴$∠BCE=∠ACB-∠ACE=60°$
∵$CE$平分$∠BCD$
∴$∠DCE=∠ECB=60°$
综上所述,$∠DCE=30°$或$∠DCE=60°$
$(3)$探究$∠ACE$与$∠ACD$的数量关系
∵点$D$,$E$在直线$MN$上运动,
$CE$平分$∠BCD$,$∠ACB=90°$
∴点$E$在点$A$的右侧
$①$点$D$在点$A$左侧时,如图$(3)$
∵$CE$平分$∠BCD$
∴$∠ACD+∠ACE=∠BCE$
∵$∠BCE=∠ACB-∠ACE=90°-∠ACE$
∴$∠ACD+∠ACE=90°-∠ACE$,
即$∠ACD+2∠ACE=90°$
$ ②$点$D$在点$A$右侧时,如图$(4)$
∵$CE$平分$∠BCD$
∴$∠DCE=∠ECB=\frac {1}{2}∠BCD$
∵$∠ACE+∠ECB=∠ACB=90°$
∴$∠ACD+∠BCD=∠ACD+2∠BCE=∠ACB=90°$
则$∠ACD+2(90°-∠ACE)=90°$
即$2∠ACE-∠ACD=90°$
综上所述,$∠ACE$与$∠ACD$的数量关系为
$∠ACD+2∠ACE=90°$或$2∠ACE-∠ACD=90°$