$解:(1)在Rt△ABC中,∵∠B=90°,AB=4,BC=2$
$∴由勾股定理,得AC= \sqrt{AB^{2}+BC^{2}}=2\sqrt{5}$
$即正方形ACEF的边长为2\sqrt{5}$
$(2)∵∠B=90°,∴∠BAC+∠BCA=90°$
$∵四边形ACEF为正方形,∴∠ACE=90°$
$∴∠BCA+∠ECD=90°,∴∠BAC=∠ECD$
$∵易得\frac{AB}{CE}=\frac{AC}{CD}=\frac{2\sqrt{5}}{5},∴△ABC∽△CED$
$∴\frac{BC}{ED}=\frac{AC}{CD}=\frac{2\sqrt{5}}{5},∴DE=\sqrt{5}$